Han blev kendt for sin kontroversielle ledelsesstil. Hans kommune blev fremhævet som en mønsterkommune af partitoppen i venstre. Det var bla. behandlingen af de ældre og de studerende og en række tiltag til gavn for integration, der var fokus på.
Eventyret sluttede dog brat i 2002 som en konsekvens af Brixtofte-sagen, der endte med en fængselsstraf.
Hvad Peter Brixtofte har at sige om den famøse sag, kan man høre i ”Q møder Peter Brixtofte”.